Desde ArcGIS puedes realizar análisis en bucle, o lotes, replicando el mismo proceso para múltiples capas y utilizando de forma tradicional las herramientas de ArcToolbox sin necesidad de recurrir a iteraciones en Model Builder. Para poder procesar masivamente varias capas sobre una herramienta, y en un solo paso, deberás abrir la herramienta de ArcToolBox en Batch.
Puedes ejecutar los análisis en lote desde ArcToolbox pinchando con el botón derecho sobre la herramienta y seleccionando la opción Batch.
Tu herramienta de gestión pasará a mostrar los parámetros requeridos a modo de campos desde donde podrás incorporar todas las capas de entrada y rutas de salida.
Ojea más GEOtips para otras aplicaciones y herramientas GIS desde aquí.